所謂異端，是指在領洗後，固執地否認某些上帝所啟示和教會所定該信的真理，或是固執地懷疑這些道理的人。異端通常不會全盤否定基督教的道理，只是將之擴大解釋，視作真理的全部。其解釋方式或推論，有可能將《聖經》所主張的真理摒棄，卻常被誤認或自視為基督徒。
站在護教立場，分辨異端是必須的。可是，誰才真正知道上帝的啟示？教會所定的真理、所作的對《聖經》的解釋是否完全根據上帝旨意？假若不然，異端根本無從說起，遑論分辨。勉強以己見為上帝旨意，審判、懲罰、打壓教內持不同意見的信眾，這是恃護教之名殺人，是極端的自私、無情，距基督教義之無私、博愛遠矣！
據資料顯示，大公會議 (世界性主教會議，用以處理重要教務和解決教義紛爭) 往往會判定並譴責某些異端思想或教派。自公元 1252 年起，教皇更批准裁判所在審訊期間用刑，包括：沒收被審者全部財產、鞭笞、終身監禁等。堅持不悔改者，下場為接受火刑。另外，裁判所有權搜捕嫌疑犯及同黨。
耶穌當初批評猶太祭司，猶太祭司制度乃上帝藉梅瑟傳給以色列人，耶穌卒之被猶太祭司陷害，釘死十字架上。今羅馬天主教會為耶穌授意門徒創立，旨在傳揚救恩喜訊、促進人類平等博愛，最後發展成為迫害教內異見分子的權力機構，教皇與「地上的國」的專制君主平起平坐，此何嘗有異於猶太祭司！教會異化，製造不少罪惡，即是墮落，墮落自然是聲名狼籍、不光彩。
裁判所要求認罪者進行公開悔過的苦行，如自我鞭打、罰款等，此乃虐待狂、貪婪之魔性心態之大混雜。
羅馬教廷後來為籌措資金，授權神職人員到歐洲各地售賣「贖罪券」，這是貪婪心態的進一步延伸，竟成斂財。
基督教的腐化還表現在十字軍東征上。
公元 1096 年，在羅馬天主教教皇准許下，西歐的封建領主和騎士 (信奉基督教) 對他們認為是異教徒的國家，發動持續近二百年的宗教戰爭。參加戰爭的士兵配有十字標誌，故稱十字軍。
十字軍東征，最初目的是抗衡伊斯蘭教，對穆斯林統治的地區作佔領，且建立一些基督教國家。不過，隨著時日推移，「基督教異端」(如信奉東正教的東羅馬帝國) 亦成為被攻打對象。
十字軍無組織、軍紀、統一發施號令者，所到之處，搶掠、偷盜，遍地焦土。多次大規模動員也令西歐各國人民損失慘重。
教廷和封建領主透過東征取得大量財富，東征等於借傳播基督教之名，行帝國侵略之實，與基督人本、博愛之教義背道而馳。
單靠篤信一外在的、超越的、全善的上帝以赦罪，脫略一內在的、自覺的、持之以恆的去除魔性獸性的工夫，竊以為是神職人員墮落的主因。
羅馬、馬其頓文化本身就是一感性、獸性文化，諸蠻族尤其是。基督文化有理想的一面，但與帝國征服、獸性等纏夾，如泥流般俱下，理想即告泯滅，一墮到底。
欲從泥沼中超拔，需要懺悔意識之生起，懺悔意識即是道德自覺心，馬丁路德 (Martin Luther) 發起「宗教改革」(Protestant Reformation)，正是直下承認教會腐敗而求一根本革新而來。
