＜懺悔品第六＞名義上是談「懺悔」，實際上卻是反覆強調主體性的重要。
＜懺悔品第六＞首先記曰：
時，大師見廣韶洎四方士庶駢集山中聽法，於是升座告眾曰：來，諸善知識！此事須從自性中起。於一切時，念念自淨其心，自修其行，見自己法身，見自心佛，自度自戒，始得不假到此。既從遠來，一會於此，皆共有緣。今可各各胡跪，先為傳自性五分法身香，次授無相懺悔。
眾胡跪。
值得注意的是「諸善知識！此事須從自性中起。於一切時，念念自淨其心，自修自行，見自己法身，見自心佛，自度自戒，始得不假到此」。這可謂道破慧能學說之宗旨。
又「自」字共出現了八次之多，可見成佛、覺悟之關鍵在於自身，即主體性 (中國思想每重視主體性，禪宗亦不例外)。
師曰：
一、戒香，即自心中無非、無惡、無嫉妒、無貪瞋、無劫害，名戒香。
二、定香，即覩諸善惡境相，自心不亂，名定香。
三、慧香，自心無礙，常以智慧觀照自性，不造諸惡；雖修眾善，心不執著，敬上念下，矜恤孤貧，名慧香。
四、解脫香，即自心無所攀緣，不思善，不思惡，自在無礙，名解脫香。
五、解脫知見香，自心既無所攀緣善惡，不可沈空守寂，即須廣學多聞，識自本心，達諸佛理，和光接物，無我無人，直至菩提，真性不易，名解脫知見香。
此慧能論述「自性五分法身香」。
概言之，「自性五分法身香」包括：
一、戒香：自心無有貪嗔、劫害等邪念。
二、定香：心常目睹諸善惡境相，卻不為其所亂。
三、慧香：心「常以智慧觀照自性，不造諸惡」，修眾善而不執著。
四、解脫香：自心無所攀緣、滯礙，不思善惡。
五、解脫知見香：自心不「沈空守寂」，而「廣學多聞」，以「達諸佛理」，「直至菩提，真性不易」。
這其實是「佛性、般若本體地自一的本心」向外彰顯、表現的五個方面。
善知識，此香各自內薰，莫向外覓。
今與汝等授無相懺悔，滅三世罪，令得三業清淨。善知識，各隨我語一時道：弟子等，從前念、今念及後念，念念不被愚迷染；從前所有惡業愚迷等罪，悉皆懺悔，願一時消滅，永不復起。弟子等，從前念、今念及後念，念念不被驕誑染；從前所有惡業驕誑等罪，悉皆懺悔，願一時消滅，永不復起。弟子等，從前念、今念及後念，念念不被嫉妒染；從前所有惡業嫉妒等罪，悉皆懺悔，願一時消滅，永不復起。
慧能認為，「佛性、般若本體地自一的本心」乃人人所固有，其因此不必向外另覓。
又此心起用時，其即可轉化、消解無明，謂之「內薰」。
另外，慧能申明「懺悔」的意思：從前念、今念、後念不被愚 / 憍誑 / 嫉妒所染污，人即可於一時間「滅三世罪」，得「三業清淨」。
慧能之說，頗有俗語「放下屠刀，立地成佛」之意味。
善知識，以上是為無相懺悔。云何名懺？云何名悔？懺者，懺其前愆。從前所有惡業、愚迷、驕誑、嫉妒等罪，悉皆懺悔，永不復起，是名為懺。悔者，悔其後過。從今以後，所有惡業、愚迷、驕誑、嫉妒等罪，今已覺悟，悉皆永斷，更不復作，是名為悔。故稱懺悔。凡夫愚迷，只知懺其前愆，不知悔其後過。以不悔故，前愆不滅，後過又生。前愆既不滅，後過復又生，何名懺悔？
此慧能進一步分析「懺」、「悔」的意思，兼及批評凡夫「懺其前愆，不知悔其後過」。
慧能認為，人對過去所做過的惡業、愚迷、驕誑、嫉妒等罪，盡皆坦然承認，且予以徹底的更改，永不復起，此之謂「懺」。至於「悔」，乃是人當下覺悟，立心保證以後不會再犯惡業、愚迷、驕誑、嫉妒等罪。
簡單些說，「懺」乃是就革除過去之罪而言，「悔」則是就今後不復再犯罪而言。
慧能指出，世人愚昧，往往只知「懺」，卻不知「悔」，以致「前愆既不滅，後過復又生」。這其實暗示出一個信息：「懺」、「悔」乃是一體兩面，相互依存的。人若只知任一者，「懺悔」必不能成功。
善知識，既懺悔已，與善知識發四弘誓願。各須用心正聽：
自心眾生無邊誓願度，
自心煩惱無邊誓願斷，
自性法門無邊誓願學，
自性無上佛道誓願成。
由慧能用「自心 / 性......誓願......」的句式來發四弘誓願，可見慧能將主體性作為斷絕煩惱、修成佛道之總樞紐。
善知識，大家豈不道眾生無邊誓願度？恁麼道，且不是惠能度。善知識，心中眾生，所謂邪迷心、誑妄心、不善心、嫉妒心、惡毒心，如是等心，盡是眾生。各須自性自度，是名真度。
何名自性自度？即自心中邪見煩惱愚癡眾生，將正見度。既有正見，使般若智打破愚癡迷妄眾生，各各自度。邪來正度，迷來悟度，愚來智度，惡來善度。如是度者，名為真度。
在慧能看來，根絕「邪迷心、誑妄心、不善心、嫉妒心、惡毒心」之道無他，只有充分彰顯「佛性、般若本體地自一的本心
(又稱「主體性」)」而已矣。此之謂「真度」。根絕「邪迷心、誑妄心、不善心、嫉妒心、惡毒心」即是「懺悔」。如是，我們不難推知：「懺悔」得以可能的根據，乃是「佛性、般若本體地自一的本心」。
又「佛性、般若本體地自一的本心」何以能根絕「邪迷心、誑妄心、不善心、嫉妒心、惡毒心」？蓋「佛性、般若本體地自一的本心」能使人得一正見，以打破一切「愚痴迷妄眾生」也。
又，煩惱無邊誓願斷，將自性般若智，除卻虛妄思想心是也。又，法門無量誓願學，須自見性，常行正法，是名真學。又，無上佛道誓願成，既常能下心，行於真正，離迷離覺，常生般若，除真除妄，即見佛性，即言下佛道成。常念修行，是願力法。
按照慧能的講法，當般若智全幅彰顯時，人一方面能自見一己之過錯，從而「懺悔」；一方面亦能自見內在固有之佛性，從而斷絕一切妄想，重行正道，久之而「佛道成」。這即是「眾生無邊誓願度」、「煩惱無邊誓願斷」、「法門無量誓願學」、「無上佛道誓願成」。
慧能的看法，明顯是將工夫重心收歸一路：開發主體性。其哲學帶有「一本論」的興味，實甚易見。
善知識，今發四弘願了，更與善知識授無相三歸依戒。善知識，歸依覺，兩足尊。歸依正，離欲尊。歸依淨，衆中尊。從今日起，稱覺為師，更不歸依邪魔外道。以自性三寶常自證明。勸善知識，歸依自性三寶。佛者，覺也。法者，正也。僧者，淨也。自心歸依覺，邪迷不生，少欲知足，能離財色，名兩足尊。自心歸依正，念念無邪見，以無邪見故，即無人我貢高貪愛執著，名離欲尊。自心歸依淨，一切塵勞愛欲境界，自性皆不染著，名衆中尊。若修此行，是自歸依。凡夫不會，從日至夜，受三歸戒。若言歸依佛，佛在何處？若不見佛，憑何所歸？言卻成妄。
如上文所言，慧能既把一切工夫之重心放在「開發主體性」上，其因此大談「從今日起，稱覺為師，更不歸依邪魔外道。以自性三寶
(案：即「覺」、「正」、「淨」)，常自證明，勸善知識，歸依自性三寶」。
善知識，各自觀察，莫錯用心。經文分明言自歸依佛，不言歸依他佛。自佛不歸，無所依處。今既自悟，各須歸依自心三寶。內調心性，外敬他人，是自歸依也。
世人每向外求佛，慧能對此看法並不苟同。
慧能重申，經文分明說「自歸依佛」，不是「歸依他佛」。人倘能「自悟」，「歸依自心三寶
(案：即上文之「自性三寶」，蓋心、性是一也)」，「內調心性，外敬他人」，其即可歸依於佛，何嘗需「騎驢覓驢」？
善知識，既歸依自三寶竟，各各志心，吾與說一體三身自性佛，令汝等見三身，了然自悟自性。總隨我道：於自色身歸依清淨法身佛；於自色身歸依圓滿報身佛；於自色身歸依千百億化身佛。
善知識，色身是舍宅，不可言歸。向者三身佛，在自性中，世人總有。為自心迷，不見內性。外覓三身如來，不見自身中有三身佛。汝等聽說，令汝等於自身中見自性有三身佛。此三身佛，從自性生，不從外得。
何名清淨法身佛？世人性本清淨，萬法從自性生。思量一切惡事，即生惡行。思量一切善事，即生善行。如是諸法，在自性中，如天常清，日月常明，為浮雲蓋覆，上明下暗。忽遇風吹雲散，上下俱明，萬象皆現。世人性常浮游，如彼天雲。
善知識，智如日，慧如月。智慧常明，於外著境，被妄念浮雲蓋覆自性，不得明朗。若遇善知識，聞真正法，自除迷妄，內外明澈，於自性中萬法皆現。見性之人亦復如是。此名清淨法身佛。
善知識，自心歸依自性，是歸依真佛。自歸依者，除卻自性中不善心、嫉妒心、諂曲心、吾我心、誑妄心、輕人心、慢他心、邪見心、貢高心，及一切時中不善之行。常自見己過，不說他人好惡，是自歸依。常須下心，普行恭敬，即是見性通達，更無滯礙，是自歸依。
何名圓滿報身？譬如一燈能除千年暗，一智能滅萬年愚。莫思向前，已過不可得。常思於後，念念圓明。自見本性。善惡雖殊，本性無二。無二之性，名為實性。於實性中，不染善惡，此名圓滿報身佛。自性起一念惡，滅萬劫善因；自性起一念善，得恒沙惡盡。直至無上菩提，念念自見，不失本念，名為報身。
何名千百億化身？若不思萬法，性本如空。一念思量，名為變化。思量惡事，化為地獄。思量善事，化為天堂。毒害化為龍蛇。慈悲化為菩薩。智慧化為上界。愚癡化為下方。自性變化甚多，迷人不能省覺，念念起惡，常行惡道。回一念善，智慧即生。此名自性化身佛。
慧能認為，如果人能充分彰顯主體性，即所謂「明心見性」，其即可歸依「一體三身自性佛」。所謂「三身自性佛」，分別指「清淨法身佛」、「圓滿報身佛」、「千百億化身佛」。
慧能對「清淨法身佛」的種種描述，頗有「起信論」系統之味道。至於他對「圓滿報身佛」、「千百億化身佛」的解釋，則近似於天台宗的「一念三千」。
善知識，法身本具，念念自性自見，即是報身佛。從報身思量，即是化身佛。自悟自修，自性功德，是真歸依。皮肉是色身，色身是舍宅，不言歸依也。但悟自性三身，即識自性佛。
「清淨法身佛」、「千百億化身佛」、「圓滿報身佛」雖有差異，其卻同出於人內在固有之佛性，所謂「此三身佛，從自性生，不從外得」。換言之，「清淨法身佛」、「千百億化身佛」、「圓滿報身佛」為同一佛性之三種表現方式，此層吾人不難想像。
＜懺悔品第六＞最後記曰：
吾有一無相頌，若能誦持，言下令汝積劫迷罪一時消滅。頌曰：
迷人修福不修道，只言修福便是道。
布施供養福無邊，心中三惡元來造。
擬將修福欲滅罪，後世得福罪還在。
但向心中除罪緣，各自性中真懺悔。
忽悟大乘真懺悔，除邪行正即無罪。
學道常於自性觀，即與諸佛同一類。
吾祖唯傳此頓法，普願見性同一體。
若欲當來覓法身，離諸法相心中洗。
努力自見莫悠悠，後念忽絕一世休。
若悟大乘得見性，虔恭合掌至心求。
師言：善知識，總須誦取，依此修行，言下見性，雖去吾千里，如常在吾邊。於此言下不悟，即對面千里，何勤遠來？珍重好去！
一眾聞法，靡不開悟，歡喜奉行。
總而言之，慧能認為，人「懺悔」、歸依「一體三身自性佛」之關鍵在於：開發、彰顯「佛性、般若本體地自一的本心」。其對主體性、自作主宰予以高度重視，此乃禪宗哲學一大特色。
