同治帝甫即位，俄國便跟清朝在陸路通商問題上展開角力。
俄國方面爭取減輕關稅，在蒙古從事商業活動不受限制，於張家口設立行棧 (存放貨物並介紹買賣的商業組織)，免去過關稽查。
清朝則堅持俄國將貨物帶來中國販賣，必須按照其他外國在華貿易的做法，繳交重稅，以避免趕絕中國商人，妨礙其生計。又蒙古幅員廣大，並非所有地方都受清朝管轄，若許俄國隨地貿易，稽查只怕不易執行。至於張家口的地理位置，鄰近北京，設立行棧，俄人隨時有機會對中央構成威脅，故清朝不許。
俄國敢於提出種種苛求，正是清朝國力走向衰落的反映。
除了東北，俄國在中國西北地區也有不少小動作。先在伊犁私自設置卡倫 (卡倫是清朝設立以執行各種巡查、稽查或監督、檢查、傳遞、徵收等種種任務為目的派兵駐守據點)，阻擋中國通往勒布希的通路 (勒布希位處新疆，今巴爾喀什湖東南、勒布希河東岸，俄國此舉，等於隔絕清朝勢力向新疆伸展)，再於各卡倫外壘立鄂博 (鄂博指立在邊境上的石碑或標誌，用來劃定兩國國界)。一言以蔽之，俄國是想取清朝而代之，控制新疆，將新疆納入其勢力範圍。
烏里雅蘇臺將軍 (即定邊左副將軍，是清代外蒙古、唐努烏梁海與科布多地方的最高軍事長官) 明誼與俄人商議中俄地界，俄國使者提出中國常駐卡倫以外地盡屬俄國，明誼不以為然，雙方各執一詞，反覆辯論。俄國在談判桌無法折服清朝，遂改為出動武力脅迫，「忽遣兵隊數百人，執持器械砲車，於伊犁卡倫附近伐木滋擾」。清朝軍力薄弱，士兵無法作戰，致使俄國恃勢凌人，一反昔日恭敬之常態。清朝依靠俄國軍事支援 (「俄人請派兵船至滬助剿粵賊，許之」、「俄人復進槍砲」)，尤其助長俄國的氣燄。
俄軍迫逼日亟，復添以回民叛亂。且說同治年間，陝西、甘肅兩省爆發大規模動亂。回族因與漢族和其他族群發生嚴重矛盾，引致大規模廝殺，清朝派兵鎮壓，未能收效。受陝甘回亂影響，新疆亦發生回亂。西寧回人妥明，乘陜甘回亂佔據烏魯木齊。中亞浩罕汗國阿古柏擊敗妥明，併吞天山北路伊犁諸城，收其賦稅收入。妥明被逐，期間身亡。有一白彥虎，陝西人，陝西回民暴動，趁機起事，在寧夏被清軍擊敗後，率領部隊撤退至甘肅，輾轉赴青海西寧，最後逃入新疆。白彥虎投靠浩罕汗國人阿古柏，活躍於天山北麓烏魯木齊一帶。英國希望通過扶植阿古柏吞併新疆，抗衡俄國，向阿古柏提供軍事援助。俄國以回民數次侵擾其邊境 (新疆與俄國接壤地區)，出兵驅逐回民，奪取伊犁，與英國對抗。
清朝想盡快平定回亂，恢復對新疆的控制，故此，伊犁將軍明緒請暫時向俄國借兵協助剿平叛亂，獲得准許。
[參考資料]
1.《清史稿・邦交一・俄羅斯》
