有一淮南道行台僕射輔公祏，於武德六年（癸未，公元六二三年）也起兵反叛。
壬子，淮南道行台僕射輔公祏反。（資治通鑑卷一百九十）
公祏初與杜伏威相友善，伏威視公祏如兄長。後來，伏威漸妒忌公祏，乃意圖潛奪其兵權。公祏知之，心中不憤，乃與左遊仙學道辟谷以自晦。伏威不久入朝，留公祏守丹楊。左遊仙說公祏謀反，但由於丹楊之兵權由雄誕所握，公祏於是詐稱得伏威書，疑雄誕有貳心，從而奪其兵。雄誕後來知公祏之計，不肯屈從，公祏於是將之縊死。公祏最後起兵反唐，且和張善安聯軍。
初，杜伏威與公祏相友善，公祏年長，伏威兄事之，軍中謂之伯父，畏敬與伏威等。伏威浸忌之，乃署其養子闞稜為左將軍，王雄誕為右將軍，潛奪其兵權。公祏知之，怏怏不平，與其故人左遊仙陽為學道辟谷以自晦。及伏威入朝，留公祏守丹楊，令雄誕典兵為之副，陰謂雄誕曰：「吾至長安，苟不失職，勿令公祏為變。」伏威既行，左遊仙說公祏謀反；而雄誕握兵，公祏不得發。乃詐稱得伏威書，疑雄誕有貳心，雄誕聞之不悅，稱疾不視事；公祏因奪其兵，使其黨西門君儀諭以反計。雄誕始寤而悔之，曰：「今天下方平定，吳王又在京師，大唐兵威，所向無敵，奈何無故自求族滅乎！雄誕有死而已，不敢聞命。今從公為逆，不過延百日之命耳，大丈夫安能愛斯須之死，而自陷於不義乎！」公祏知不可屈，縊殺之。雄誕善撫士卒，得其死力，又約束嚴整，每破城邑，秋毫無犯。死之日，江南軍中及民間皆為之流涕。公祏又詐稱伏威不得還江南，貽書令其起兵，大修鎧仗，運糧儲。尋稱帝於丹楊，國號宋，修陳故宮室而居之。署置百官，以左遊仙為兵部尚書、東南道大使、越州總管，與張善安連兵，以善安為西南道大行台。（資治通鑑卷一百九十）
輔公祏起兵後，高祖命李孝恭、李靖、黃君漢、李世勣兵分四路討伐。
乙丑，詔襄州道行台僕射趙郡王孝恭以舟師趣江州，嶺南道大使李靖以交、廣、泉、桂之眾趣宣州，懷州總管黃君漢出譙、亳，齊州總管李世勣出淮、泗，以討輔公祏。（資治通鑑卷一百九十）
孝恭為人頗機智，此在其言「此乃公祏授首之征」一事中可見。
孝恭將發，與諸將宴集，命取水，忽變為血，在坐皆失色，孝恭舉止自若，曰：「此乃公祏授首之征也！」飲而盡之，眾皆悅服。（資治通鑑卷一百九十）
在唐軍迫逼下，輔公祏亦不甘示弱。其遣大將徐紹宗寇海州，陳政通寇壽陽。
戊子，輔公祏遣其將徐紹宗寇海州，陳政通寇壽陽。（資治通鑑卷一百九十）
黃州總管周法明領兵擊輔公祏，屯荊口鎮。張善安趁法明登戰艦飲酒，遣刺客數人乘魚鰈而至，殺法明而去。
黃州總管周法明將兵擊輔公祏，張善安據夏口，拒之。法明屯荊口鎮，壬午，法明登戰艦飲酒，善安遣刺客數人詐乘魚鰈而至，見者不以為虞，遂殺法明而去。（資治通鑑卷一百九十）
法明雖死於善安所派的刺客手上，舒州總管張鎮周等卻擊破輔公祏之部將陳當世。
甲申，舒州總管張鎮周等擊輔公祏將陳當世於猷州之黃沙，大破之。（資治通鑑卷一百九十）
武德六年，十二月，癸卯，安撫使李大亮誘獲張善安。
十二月，癸卯，安撫使李大亮誘張善安，執之。（資治通鑑卷一百九十）
且說大亮與善安在洪州對戰，大亮向善安諭以禍福，又渡水入其軍陣，與善安執手共語，以示友好。善安於是答應投降，且領數十騎兵進入大亮的軍營。不料，善安進入軍營，與大亮交談了一段時間，善安欲辭去時，大亮竟命武士將之捕捉。
大亮擊善安於洪州，與善安隔水而陳，遙相與語。大亮諭以禍福，善安曰：「善安初無反心，正為將士所誤；欲降又恐不免。」大亮曰：「張總管有降心，則與我一家耳。」因單騎渡水入其陳，與善安執手共語，示無猜間。善安大悅，遂許之降。既而善安將數十騎詣大亮營，大亮止其騎於門外，引善安入，與語，久之，善安辭去，大亮命武士執之，從騎皆走。（資治通鑑卷一百九十）
善安被大亮所執後，善安營中之兵士本欲攻大亮，大亮卻訛稱善安非為其所執，乃善安自身「自留不去」。結果，善安營中之兵士皆潰去。大亮乘機追擊，善安士卒被虜者不少。善安後被送至長安，因其稱不曾與公祏交通，高祖於是對之加以重用。然而，自公祏敗，善安與公祏往還之書信被揭露，高祖終識破善安之謊言，遂殺之。
善安營中聞之，大怒，悉眾而來，將攻大亮。大亮使人諭之曰：「吾不留總管。總管赤心歸國，謂我曰：『若還營，恐將士或有異同，為其所制。』故自留不去耳，卿輩何怒於我！」其黨復大罵曰：「張總管賣我以自媚於人。」遂皆潰去。大亮追擊，多所虜獲。送善安於長安，善安自稱不與輔公祏交通，上赦其罪，善遇之；及公祏敗，得所與往還書，乃殺之。（資治通鑑卷一百九十）
輔公祏並未因善安降唐而停止擴張。武德七年（甲申，公元六二四年）二月，辛丑，輔公祏派兵圍猷州，刺史左難當據城自守。
二月，辛丑，輔公祏遣兵圍猷州，刺史左難當嬰城自守。（資治通鑑卷一百九十）
唐軍中李大亮、李孝恭出兵攻輔公祏，公祏先後兩度戰敗。
安撫使李大亮引兵擊公祏，破之。趙郡王孝恭攻公祏鵲頭鎮，拔之。（資治通鑑卷一百九十）
李孝恭擊輔公祏別將於樅陽，大破之。權文誕破輔公祏之黨於猷州，盡取其枚洄等四鎮，事在武德七年。
壬午，趙郡王孝恭擊輔公祏別將於樅陽，破之。（資治通鑑卷一百九十）
壬子，行軍副總管權文誕破輔公祏之黨於猷州，拔其枚洄等四鎮。（資治通鑑卷一百九十）
武德七年，二月，杜伏威逝世。初，李孝恭以為公祏之反乃出於伏威之命，上奏高祖，高祖於是下令追除伏威名，籍沒其妻子。直至唐太宗即位，伏威才被平反。
是月，太保吳王杜伏威薨。輔公祏之反也，詐稱伏威之命以紿其眾。及公祏平，趙郡王孝恭不知其詐，以狀聞；詔追除伏威名，籍沒其妻子。及太宗即位，知其冤，赦之，復其官爵。（資治通鑑卷一百九十）
公祏方面，其屢為李孝恭所敗，失去梁山等三鎮、丹楊。
丙戌，趙郡王孝恭破輔公祏於蕪湖，拔梁山等三鎮。（資治通鑑卷一百九十）
戊戌，趙郡王孝恭克丹楊。（資治通鑑卷一百九十）
最初，輔公祏本來派遣其將馮慧亮、陳當世率領水軍三萬屯博望山，陳正通、徐紹宗領步騎二萬屯青林山，且於梁山連鐵鎖以斷江路，築卻月城，又結壘江西以抵抗官軍。
先是，輔公祏遣其將馮慧亮、陳當世將舟師三萬屯博望山，陳正通、徐紹宗將步騎二萬屯青林山，仍於梁山連鐵鎖以斷江路，築卻月城，延袤十餘里，又結壘江西以拒官軍。（資治通鑑卷一百九十）
李孝恭與李靖領水軍至舒州，李世勣則率領步卒一萬渡淮水，拔壽陽，次硤石。公祏方面，慧亮採堅壁清野之戰術，孝恭於是絕其補給，以令慧亮軍中乏食。
孝恭與李靖帥舟師次舒州，李世勣帥步卒一萬渡淮，拔壽陽，次硤石。慧亮等堅壁不戰，孝恭遣奇兵絕其糧道，慧亮等軍乏食，夜，遣兵薄孝恭營，孝恭安臥不動。（資治通鑑卷一百九十）
孝恭意圖領兵直攻丹楊，李靖以為不可，主張攻公祏在江西之據點，孝恭依從其計。於是，其派老弱之兵士故作攻公祏之地，以引公祏之兵士追擊，再而於途中埋伏精兵，把公祏等人一網打盡。
孝恭集諸將議軍事，皆曰：「慧亮等擁強兵，據水陸之險，攻之不可猝拔，不如直指丹楊，掩其巢穴。丹楊既潰，慧亮等自降矣！」孝恭將從其議，李靖曰：「公祏精兵雖在此水陸二軍，然後自將亦為不少，今博望諸柵尚不能拔，公祏保據石頭，豈易取哉！進攻丹楊，旬月不下，慧亮等躡吾後，腹背受敵，此危道也。慧亮、正通皆百戰餘賊，其心非不欲戰，正以公祏立計使之持重，欲以老我師耳。我今攻其城以挑之，一舉可破也！」孝恭然之，使羸兵先攻賊壘而勒精兵結陳以待之。（資治通鑑卷一百九十）
孝恭等人之計果然成功，加上公祏之部屬多為闞稜舊日部曲，結果，賊眾大敗。
攻壘者不勝而走，賊出兵追之，行數里，遇大軍，與戰，大破之。闞稜免冑謂賊眾曰：「汝曹不識我邪？何敢來與我戰！」賊眾多稜故部曲，皆無鬥志，或有拜者，由是遂敗。（資治通鑑卷一百九十）
在孝恭、李靖、世勣等人的努力下，公祏終於兵敗，被送至丹楊梟首。至此，江南遂被平定。
孝恭、靖乘勝逐北，轉戰百餘里，博山、青林兩戍皆潰，慧亮、正通等遁歸，殺傷及溺死者萬餘人。李靖兵先至丹楊，公祏大懼，擁兵數萬，棄城東走，欲就左遊仙於會稽，李世勣追之。公祏至句容，從兵能屬者才五百人，夜，宿常州，其將吳騷等謀執之。公祏覺之，棄妻子，獨將腹心數十人，斬關走。至武康，為野人所攻，西門君儀戰死。執公祏，送丹楊梟首，分捕餘黨，悉誅之，江南皆平。（資治通鑑卷一百九十）
公祏一役，孝恭、李靖出力不少，被高祖論功行賞。然而，闞稜由於自恃功大，加上被公祏誣告其與己通謀。終於，闞稜被判以謀反罪，加以誅殺。
己亥，以孝恭為東南道行台右僕射，李靖為兵部尚書。頃之，廢行台，以孝恭為楊州大都督，靖為府長史。上深美靖功，曰：「靖，蕭、輔之膏肓也。」（資治通鑑卷一百九十）
闞稜功多，頗自矜伐。公祏誣稜與己通謀。會趙郡王孝恭籍沒賊黨田宅，稜及杜伏威、王雄誕田宅在賊境者，孝恭並籍沒之；稜自訴理，忤孝恭，孝恭怒，以謀反誅之。（資治通鑑卷一百九十）
