錢穆反對用實證科學方法研究人文界，主張另建立人文科學，見於＜科學與人生＞、＜緊張與鬆弛＞、＜推概與綜括＞、＜直覺與理智＞、＜無限與具足＞、＜價值觀與仁慈心＞，今撮鈔各篇要旨於下。
I. ＜科學與人生＞
要把握整個世界、人生之真相，用科學頭腦、冷靜、純理智的求真永遠做不到，理由是：世界、人生本身都不是冷靜、純理智。
視聽根本是一個動，滲進人的熱血，附帶著一番情緒、欲望。若把人生的熱血冷靜下來，把人生的情欲洗淨，來探求科學真理，那些科學真理對人生未必有好處，極有可能帶來壞處。
人生不是行屍走肉。家庭乃至任何團體，人生的場合，不是屍體陳列所。面對著活潑潑的生人，決不能讓你頭腦冷靜，決不能讓你純理智。倘若你真要用純冷靜、純理智的頭腦尋求對於活人的知識，把走進解剖室的那一種頭腦和心情來走進你的家庭和任何人群團體，你將永不得人生之真相。
冷靜，純理智和科學頭腦，或許可得到某幾種生理病態的知識，但病態不就是生機。人總是熱和血之動，情與欲之交流，把活人當死人看，此一心理習慣，其實不人道。
須知整個世界、人生都不單純，變動不居，與日俱新，事態一去不復來，絕不能老在一個狀態上反復無窮。科學家要求自己頭腦冷靜，要純理智，在處理單純而能無窮反復的事態上可以，但落到世界和人生，其絕不像實驗室裡的一切，彼那種心智習慣實甚有害。科學知識的用處，遠遠抵償不過此一心智習慣所帶來的害處。
更好的做法是，明白實證科學只是尋求知識的一條路，一種方法。我們須將科學態度和科學方法大大地解放，在科學中也放進熱和血之動，在科學中也滲入人之情感與欲望，從而讓科學走進人生廣大而複雜的場面。後一種科學，可稱為人文科學，以別於實證科學所成就的自然科學。
我們要有複雜的、變動的、熱情的人生科學，來運用那些單純的、靜定的、純理智的、非人生的自然科學。
II. ＜緊張與鬆弛＞
人心分成緊張與鬆弛兩型。前一型的人，宜於在自然科學上探求。後一型的人，宜於在人文科學上體會。前一型的人，情感是強烈的，富於侵入性。後一型的人，情感是平淡的，富於感受性。西方民族比較前一型的多些，中國人則比較後一型的多些。
西方自然科學是緊張心緒下的產物。他們愛把一切不相干的東西盡量剔除，專從一點上直線深入，因此便有一切科學知識之發現。宗教也是緊張心緒下的產物。一切西方宗教經驗下之種種見神見鬼，在心緒鬆弛的人看來，都像是神經過敏。其他如戀愛心理戰爭心理，也都是緊張型的產物，都要火熱地不顧一切地向某一點衝進。這種心態根本不安和、不寧定。
莊子頌讚虛靜，禪宗說常惺惺，程朱言居敬。所謂虛靜，並不要他心上空無所有，只是鬆弛，不緊張，無組織，平鋪地覺醒，把全個心態敞開，開著門，開著窗，讓他八面玲瓏，時時通風，處處透氣，外面的一切隨時隨地可以感受，內面的一切隨時隨地可以鬆動，全域機靈沒有壓抑，沒有嚮往，這時是常惺惺，是敬，也是活潑天機。如是的人，不在自己心裡築圍牆，也不能信宗教，因他不會有那些見神見鬼的宗教上的活經驗。如是的態度，也不會向一點直前鑽，因而不能發明近代西方自然科學上的種種新知識。
緊張心緒，應用在宗教上，是上帝與魔鬼之對立。應用在哲學上，是精神與物質的二元論。應用在政治社會的組織上，是階級與法治。應用在人生上，是強力奮鬥與前進。應用在理智上，是多角形的深入與專精。後一種鬆弛心緒，應用在宗教上，是天人合一。應用在哲學上，是萬物一體的一元論。應用在政治社會的組織上，是大同與太平的和平理想。應用在人生上，是悠閒恬淡與寧靜。應用在理智上，是物來順應，斟情酌理，不落偏見。
III. ＜推概與綜括＞
知識對象分為自然與人文兩大類。對象不同，求知的心習與方法亦當隨而變。
自然科學的主要骨幹是象數之學，象數之學最抽象最不具體，但也是最可推演，推一可以概萬，不煩人類一一經驗。儘管近代自然科學已有不少運用綜括的知識，對歸納法亦予以重視，但到底抽象重於具體，重量過於重質，推概重於綜括，演繹重於歸納，人類還是想慕那些超經驗的客觀的自明真理。
人文科學講究經驗的累積，經驗如何可用純形式的，無內容的，超經驗的象數之學一類的靜定的格套來駕馭，來推概？只有把一切現象，只要能知道的，全部羅列，做成各種分類，排成各種序列，來解釋，來想像，來透進其內部而從事於再經驗。此將成就一種綜括性的蓋然的知識，決不能造成推概性的必然的理論。事實上，所謂人文學的一切知識，更須綜括，更只能獲得一種大體勢的蓋然性的想像和解釋。
先從某一點上直線推演出一套理論，再從這一套理論上用革命手段來求其實現。凡與這一條直線的理論不相適合的一切排除，若把這一套精神運用到人文界，則人類文化前途，受福的分數到底敵不住受禍的分數更多些。
人文科學尊重經驗，愛把一點一點的經驗綜括起來，不肯專從某一點經驗上甚至某一個概念上來建立系統，更不敢用一條直線式的演繹來作出邏輯的必然定論。只在每一點經驗上有限地放大，做成一小圓形的蓋然的推說。點與點之間，常留鬆動與推移之餘地。不輕易想把那些一點一點的經驗在某一理論下嚴密地組織。理論決不遠離了經驗向前跑。不輕易使理論組織化與系統化。默識心通取代言辯的往前直推，深入一物之內裡，來作一番同情的再經驗，並看重優異的個別性，看重其領導性與標準性，不愛作形式上的歸類，重質而不重量，愛作一渾整的全體看，不愛分割，不尚偏鋒。
自然科學容易導致用人力改造自然，人文科學則常愛用同情來護惜自然。
IV. ＜直覺與理智＞
思想分兩種，一種是運用語言文字而思想，一種是不憑藉語言文字而思想。後一種叫做默思 (又稱本能、直覺)。
人類運用思想，多要憑藉語言文字。憑藉語言文字的思想，只是把思想平鋪開。
默思不看重語言文字之分析，看似神秘、籠統、不科學，卻自然不過，體現天人合一、萬物一體的境界。
理智是分析的，直覺是渾成的。人類心態由渾成展演而為分析，歸功於語言的發明。換言之，人類心靈其先也只是直覺用事而已，必待語言發明逐漸使用，然後逐漸從直覺轉化出理智來。
理智是較淺較顯的，直覺是較深較隱的。理智是人文的，後天的，而直覺則是自然的，先天的。直覺是理智的根源。
V. ＜無限與具足＞
西方人想像時間，猶如一直線，過去無限，將來無限，人生乃自無限過去，跨越現在，以進入無限之將來。印度佛教看人生，大體與近代西方人相近，三世無限，斯六道輪回亦無限。
歐洲人見人生無限，而勇於追逐，樂於長往，不厭不倦，義不反顧。佛教教義憫此長途之悠悠不盡，而願為濟渡，願為解脫，願為入於無餘涅槃而滅度之。然諸佛菩薩皆盡未來際作諸功德，則仍屬一種無限向前。
中國人之時間觀是環形的、球體的、非線狀的。宇宙為一球體，人生亦成一球體，死後則回復到生前，如環無端，圓成一體。
若要抱一種無限向前的人生觀，你必視現實人生為缺陷，為不足，必勇於捨棄，樂於追尋，必懸一遠離現實之理想，而甘願於捨棄一切而奔赴。近代歐洲人之科學精神與其以前之宗教信仰，同為此種捨棄，追尋，永永向前的人生精神之表現。佛教精神雖若消極，然一樣的勇於捨棄，樂於追尋，其為一種無限向前之人生則同。
中國人並不肯無限向前，因亦不勇於捨棄，不樂於追尋，徒欲於現實人生中得一種當下現前之圓滿具足。
拾取西方人生之外皮，高抬嗜欲，不恥奔競，一面對現實抱不滿，一面卻仍是將就現實索補償，如是則不惟自苦，亦以擾人。
VI. ＜價值觀與仁慈心＞
近代西方二三百年來物質科學進步，人文科學卻落後脫節，其弊已顯。究其原因，還在它們的方法上。科學須面對事實，在事實上面去求知識，只要事實有新發現，知識便該立刻追隨求調整。宗教上的信仰和理論則不因人事轉變而改變。兩者因而有衝突。
把物質科學的律則來代替宗教指導人文，人類社會本身依然無地位、無重量。從前是聽命於宗教，聽命於人類以外的上帝。現在是聽命於物質，依然要聽命於人類以外之另一位上帝。
要認真研究人類社會，不能把研究人類社會以外的一番法則與理論轉移過來，而應切實針對人類社會之自身。要求對於某項事類有真知識，則必向該項事類之本身去找尋。此乃一切科學最普通基本的律則。故此，要建立新的人文科學，既不應該乞靈於牛頓與達爾文，也不應該乞靈於上帝或神。人文科學必含有價值面向，抹殺了價值，抹殺了階級等第而來研究人文科學，要想把自然科學上的一視平等的精神移植到人文科學的園地裡來，這只會令人文科學不能理想發展。
物質科學家乃至生命科學家，可以是純理智的，不動自己的情感，而且也應該純理智，應該不夾雜絲毫情感的。但若研究人文科學，則不可能也不應該不羼進自己的一份情感。人文科學家不應該像自然科學家一樣，對他研究的物件，只發生興趣，而沒有絲毫的情感，如自然科學家般的冷淡和嚴肅。他必須對研究的物件，有一番極廣博極誠摯的仁慈之心。
價值觀、仁慈心是建立人文科學所必備的兩要件。要尋求一種心習，富於價值觀，又富於仁慈心，而又不致染上宗教色彩的，而又能實事求是向人類本身去探討人生知識的，而又不是消極與悲觀，如印度佛學般只講出世的，那只有中國的儒家思想。儒家思想是一種人文科學。至少與我們理想中要建立的人文科學很接近，它已具備了想要建立人文科學所必需的幾個心習。儒家的很多理論，將來必為新興的人文科學所接受。
| 自然科學 | 人文科學 | |
| 研究對象 | 人類以外的物質世界 (冰冷無情、單純靜定) | 人類自身 (滲有熱血，附帶一番情緒、欲望，有價值面向，複雜多變) |
| 思維模式 | 純冷靜、純理智的頭腦 | 純冷靜、純理智的頭腦 + 價值觀、仁慈心 |
| 心態 | 較緊張 (不安和、不寧定) | 較鬆弛 (安和、不寧定) |
| 研究方法 | 演繹法，著重抽象的推演 (用人力改造自然)，運用語言文字來思想 (條分縷析) | 歸納法，著重經驗的綜括 (用同情來護惜自然)，默思 (渾成，體現天人合一、萬物一體的境界) |
| 時間觀 | 線性，無限向前 (視現實人生為缺陷，為不足，必勇於捨棄，樂於追尋，必懸一遠離現實之理想，而甘願於捨棄一切而奔赴) | 環形的、球體的 (不勇於捨棄，不樂於追尋，於現實人生中得一種當下現前之圓滿具足) |
