他又擔心官員之間互相勾結，妄議朝政，結黨營私，對朋黨非常忌諱。李紱、謝濟世便是因朋黨而獲罪。
考慮到福建沿海百姓生活艱難，雍正帝同意放寬海禁。不過，他始終對外洋回來的人民存有戒心，也嚴禁中國商人出海經商。
另外，雍正帝下令開豁賤民，編入正戶，准許其置產定居、參加科舉考試。
傳教士介入奪嫡之爭、歐洲天主教國家不斷向東方侵略等因素，令雍正帝對天主教的傳播再難包容。他擔心繼續讓傳教士進入中國，越來越多民眾信奉天主教，將造成國家政令無法貫徹，國內騷動此起彼落。為免後患，遂下令「西洋之教不必行於中國」，除留京任職的傳教士外，一律送往澳門。各地天主堂或被拆毀，或改為公廨。民間嚴厲禁止信仰天主教，史稱「雍正禁教」。禁教令至道光始解除。
有見於國家承平日久，軍備廢弛，八旗子弟終日遊手好閒，貪圖享樂，雍正帝下令分配土地和農具給他們，讓其自力更生，部份八旗子弟被派往前線作戰。
針對科舉制度，雍正帝實行了一系列改革，如變更考試內容和重點、增設考試科目，放寬考生資格限制、改變一試定終身等，務求更有效選拔人才。
雍正十三年 (1735 年) 八月，雍正帝在批閱奏章時突然崩逝，享年五十七歲。第四子弘曆繼位，是為乾隆皇帝。
關於雍正死因，眾說紛紜，今試簡單分析如下：
I. 呂四娘行刺
呂四娘是呂留良的女兒，為替父祖報仇，習練武藝，後入宮行刺雍正帝，把他殺掉。
觀乎呂留良後人仍有從事各行各業，只是遭受嚴格管制，不能自由活動，呂四娘替祖上報仇實無必要。此說純屬民間傳聞。
II. 服食丹藥中毒
雍正帝服用道士張太虛、王定乾等人煉製的丹藥，身體中毒，暴斃身亡。
觀乎雍正帝常與道士接近，對道家丹藥有強烈興趣，平時愛服食，亦曾賜丹給寵臣鄂爾泰與田文鏡，他極有可能因服食丹藥中毒而死。復看乾隆帝在雍正帝死後第三天，即下令驅逐道士張太虛等人，事情更加耐人尋味，乾隆上諭曰：
皇考萬幾之餘，聞外間爐火修煉之說，聖心深知其非，聊欲試觀其術，以為遊戲消閒之具，因將張太虛、王定乾等數人置於西苑空閒之地，聖心視之與俳優人等耳，未曾聽其一言，未曾用其一藥。且深知其為市井無賴之徒，最好造言生事，皇考向朕與親王面諭者屢矣。今朕將伊等逐出，各回本籍。……若伊等因內廷行走數年，捏稱在大行皇帝御前一言一字，以及在外招搖煽惑，斷無不敗露之理，一經訪聞，定嚴行拿究，立卽正法，決不寬貸。
「聖心深知其非，聊欲試觀其術，以為遊戲消閒之具」，這是為雍正帝粉飾，實情是他好「爐火修煉之說」。
何以他會好「爐火修煉之說」？「萬幾之餘」給出了提示。日常處理的政務太紛繁，精神不夠。相當於今人疲累需要喝咖啡或能量飲品提神醒腦。
「未曾聽其一言，未曾用其一藥」，何故乾隆帝要特別強調？除非雍正帝根本愛聽張太虛、王定乾之言，常服食其所煉丹藥。
經過拆解，更準確的死因其實已經出現。
III. 操勞過度致死
《硃批諭旨》有以下兩條文字：
此等奏摺皆出朕之心思，無一件假手於人，亦無一人贊襄於側，非如外廷宣布之諭旨尚有閣臣等之撰擬也。
雍正六年以前......燈下批閱奏摺，每至二鼓三鼓，不覺稍倦，寔六載如一日，此左右近侍及內直大臣所稱知者。近年以來，天下庶政，漸次就理，下情稍覺洞達，臣工奏摺較前減少，而朕躬精力亦不如前。批答之事，始從簡便，此實情實事可舉以告天下者。
「二鼓三鼓」是一個怎樣的概念？「二鼓」相當於晚上九時至十一時，「三鼓」相當於晚上十一時至凌晨一時，而早朝是凌晨五時左右開始，換句話說，雍正帝連續六年睡眠時間不足四小時。不止於此，每晚還要親自批閱奏摺，短則數百，長則數萬、數千言批語。試問一個將近五十歲的中年人體質，如何承受得下去？服食丹藥乃迫不得已。
鄭天挺認為雍正是中風死去，也有這個可能。要之，中毒也好，中風也好，根本原因離不開操勞過度。
