高麗、百濟雖被平定，但其並未滅族。二氏之滅亡，直需待到儀鳳二年（丁丑，公元六七七年）二月。
儀鳳元年（丙子，公元六七六年）二月，甲戌，高宗在遼東做了一連串的佈置。其先後徙安東都護府於遼東故城、徙熊津都督府於建安故城、罷免任東官的華人、把徙於徐兗等州的百濟戶口安置於建安。
二月，甲戌，徙安東都護府於遼東故城；先是有華人任東官者，悉罷之。徙熊津都督府於建安故城；其百濟戶口先徙於徐、兗等州者，皆置於建安。（資治通鑑卷二百零二）
儀鳳二年（丁丑，公元六七七年）二月，高宗又以工部尚書高藏為遼東州都督，封朝鮮王，使歸遼東，安集高麗餘衆。先在諸州居住之高麗人士，亦被遣與高藏一同歸國。
二月，丁巳，以工部尚書高藏為遼東州都督，封朝鮮王，遣歸遼東，安輯高麗餘眾；高麗先在諸州者，皆遣與藏俱歸。（資治通鑑卷二百零二）
對於扶餘隆，高宗以之為熊津都督，封帶方王，亦遣歸以安集百濟餘眾。高宗又移安東都護府於新城以統制之。
又以司農卿扶餘隆為熊津都督，封帶方王，亦遣歸安輯百濟餘眾，仍移安東都護府於新城以統之。（資治通鑑卷二百零二）
由於當時的百濟地方殘破，扶餘隆於是寓居於高麗之境。
時百濟荒殘，命隆寓居高麗之境。（資治通鑑卷二百零二）
本來，高宗並無趕盡殺絕之意。可是，高藏至遼東，竟暗中與靺鞨交通，意圖謀反。其於是被召回中原，另徙邛州而死。高麗人亦被徙於河南、隴右諸州，貧者則留於安東城旁邊。
藏至遼東，謀叛，潛與靺鞨通；召還，徙邛州而死，散徙其人於河南、隴右諸州，貧者留安東城傍。（資治通鑑卷二百零二）
高麗舊城為新羅所吞沒，高麗之餘眾亦分別散入靺鞨及突厥，扶餘隆不敢返還故地，高氏、扶餘氏於是滅亡。
高麗舊城沒於新羅，餘眾散入靺鞨及突厥，隆亦竟不敢還故地，高氏、扶餘氏遂亡。（資治通鑑卷二百零二）
