雍正四年 (1726 年)，查嗣庭任江西鄉試正主考，按照慣例，他擬定考題：第一題是「君子不以言舉人，不以人廢言」，第二題是「正大而天地之情可見矣」，第三題是「其旨遠其辭文」，第四題是「百室盈止，婦子寧止」。由於試題中先有「正」字，後有「止」字，民間傳說他以「維民所止」為題，繼而有人劾告「維止」二字是指雍正無頭。
適逢其家中被抄出筆札詩稿及《維止錄》，徐珂《清稗類鈔》：
因查其筆札詩草，語多悖逆，遂伏誅......查嘗著《維止錄》一書，取明亡大廈已傾得清維之而止也。世宗覽之，初甚嘉許，謂其識大義。太監某進曰：「此背逆書耳，何嘉焉？」世宗詢以故，某曰：「縱觀之，見其頌揚我朝，若橫觀之，盡是詆斥滿洲耳。」世宗側其畫觀之，果然，遂大怒......查之《維止錄》專記世宗宮廷曖昧事......
查嗣庭終於被逮捕下獄，不久戮屍梟示，史稱「查嗣庭案」。事後浙江鄉試暫停，三年後才恢復，查氏親族、子弟多人受株連。
雍正三年 (1725 年)，隆科多開始被撤職奪官。雍正五年 (1727 年)，蔡珽被懷疑與李紱、謝濟世結黨營私，跟田文鏡 (背後是雍正帝)
為敵，判死刑，後釋放。
有學者認為，查嗣庭案實際是雍正帝削弱和打擊隆科多一派勢力的「連環案」之一，非純粹的文字獄。
《清實錄・雍正朝實錄》有以下一條：
查嗣庭請托賄囑之書札，不一而足。其日記所載狂妄悖逆之語，與汪景祺相為表裡，而其誹議聖祖仁皇帝用人行政，大逆不道之言，不可勝舉。
據此，查嗣庭真正的罪狀有三：
1. 暗中行賄；
2. 跟權臣勾結，對雍正帝不利；
3. 非議批評康熙帝用人行政。
這也不是可以用文字獄一筆蓋過。
汪景祺，浙江杭州人，少年時豪邁不羈，與年羹堯友好，成為其幕客。年羹堯西征，汪景祺隨伴在側，著《讀書堂西征隨筆》，指歷代名將郭子儀、裴度等「較之閣下威名，不啻螢光之於日月，勺水之於滄溟。蓋自有天地以來，制敵之奇，奏功之速，寧有盛於今日之大將軍哉！」獻年羹堯收藏。年羹堯不久失勢，《讀書堂西征隨筆》被抄出送入宮中。雍正帝見之，怒斥汪景祺「大逆不道」，他最後被梟首示眾，妻子發配黑龍江為奴，兄弟親人皆遭革職，事在雍正三年，較查嗣庭案早一年。
又有一錢名世，江蘇人，因賦詩讚揚年羹堯平定青海叛亂，被雍正帝冠以「曲盡諂媚、頌揚奸惡」罪名，革去職務。雍正帝更親自寫上「名教罪人」四字懸其門，並命諸位大臣寫詩文聲討其劣跡惡行，事在雍正四年，與查嗣庭案同年。
綜合而觀，查嗣庭案似非獨立事件，與汪景祺案、錢名世案一脈相承，都和雍正帝扳倒權臣年羹堯、隆科多有關。正因為官員多不可信賴，雍正帝才特別寵信李衛、田文鏡等人。
查嗣庭兄長為查慎行，查慎行曾受經史於黃宗羲，康熙四十二年 (1703 年) 中進士，成為翰林院編修，入值南書房。受查嗣庭案牽連，被逮捕，後返歸田里。
當代武俠小說大師金庸先生，原名查良鏞，是查嗣庭的後人。
