高宗即位後，其雖仍可恪守太宗之遺教，但是，從另一方面觀，問題已經暗中出現。
第一個問題為高宗過分重視、信用外戚。
（永徽二年）春，正月，乙巳，以黃門侍郎宇文節、中書侍郎柳奭並同中書門下三品。奭，亨之兄子，王皇后之舅也。（資治通鑑卷一百九十九）
早在太宗時，其已因過分重用長孫無忌，為長孫皇后勸止。然太宗之重用無忌，尚由於無忌之有才幹。可是，觀乎高宗之用王仁祐、柳奭，其更多是因為王皇后。日後唐中宗曾發讓位給岳父韋玄貞之妄言，此極有可能是得自父親信用外戚的性格。
第二個問題是官員多「互觀顏面」，未能盡公，所謂「小小收取人情」。
上謂宰相曰：「聞所在官司，行事猶互觀顏面，多不盡公。」長孫無忌對曰：「此豈敢言無；然肆情曲法，實亦不敢。至於小小收取人情，恐陛下尚不能免。」無忌以元舅輔政，凡有所言，上無不嘉納。（資治通鑑卷一百九十九）
我們試回想一下貞觀初年大臣之相處共事。魏徵、王珪等人焉有「互觀顏面」之舉？其共同為國事而努力則有，互相揣摩顏色，不敢開罪對方則無。所謂「互觀顏面，多不盡公」，嚴格言之，乃貞觀晚年之官場陋習。今無忌竟以「小小收取人情，恐陛下尚不能免。」為此陋習辯解，永徽政風稍遜於貞觀初年之政風，事甚顯然。
第三個問題為蠻族屢反。
（永徽元年）十二月，庚午，梓州都督謝萬歲、兗州都督謝法興與黔州都督李孟嘗討琰州叛獠；萬歲、法興入洞招慰，為獠所殺。（資治通鑑卷一百九十九）
（永徽二年）己卯，郎州白水蠻反，寇麻州，遣左領軍將軍趙孝祖等發兵討之。（資治通鑑卷一百九十九）
竇州、義州蠻酋李寶誠等反，桂州都督劉伯英討平之。（資治通鑑卷一百九十九）
幸得趙孝祖等人才，亂事才得以被平定。
（永徽二年）郎州道總管趙孝祖討白水蠻，蠻酋禿磨蒲及儉彌於帥眾據險拒戰，孝祖皆擊斬之。會大雪，蠻饑凍，死亡略盡。孝祖奏言：「貞觀中討昆州烏蠻，始開青蛉、弄棟為州縣。弄棟之西有小勃弄、大勃弄二川，恆扇誘弄棟，欲使之反。其勃弄以西與黃瓜、葉榆、西洱河相接，人眾殷實，多於蜀川，無大酋長，好結仇怨，今因破白水之兵，請隨便四討，撫而安之。」敕許之。（資治通鑑卷一百九十九）
（三年）夏，四月，趙孝祖大破西南蠻，斬小勃弄酋長歿盛，擒大勃弄酋長楊承顛。自餘皆屯聚保險，大者有眾數萬，小者數千人，孝祖皆破降之，西南蠻遂定。（資治通鑑卷一百九十九）
第四個問題為崇佛之風漸盛。
九月，癸巳，廢玉華宮為佛寺。（資治通鑑卷一百九十九）
由高祖下迄至太宗，其皆甚少把宮殿改為佛寺。今高宗竟「廢玉華宮為佛寺」，唐佛風之盛，多少始於高宗。
慶幸的是，高宗一朝有褚遂良、宇文節、韓璦等大臣。
（永徽三年）己巳，以同州刺史褚遂良為吏部尚書、同中書門下三品。（資治通鑑卷一百九十九）
三月，辛巳，以宇文節為侍中，柳奭為中書令，以兵部侍郎三原韓璦守黃門侍郎、同中書門下三品。（資治通鑑卷一百九十九）
高宗又重用來濟、高履行（高士廉的兒子）。
（永徽三年）九月，守中書侍郎來濟同中書門下三品。（資治通鑑卷一百九十九）
丁丑，上問戶部尚書高履行：「去年進戶多少？」履行奏：「去年進戶總一十五萬。」因問隋代及今日見戶，履行奏：「隋開皇中，戶八百七十萬，即今戶三百八十萬。」履行，士廉之子也。（資治通鑑卷一百九十九）
加上高宗善納諫言。
庚戌，左武候引駕盧文操逾牆盜左藏物，上以引駕職在糾繩，乃自為盜，命誅之。諫議大夫蕭鈞諫曰：「文操情實難原，然法不至死。」上乃免文操死，顧侍臣曰：「此真諫議也！」（資治通鑑卷一百九十九）
並且重視農業。
（永徽三年）丙子，以饗太廟；丁亥，饗先農，躬耕籍田。（資治通鑑卷一百九十九）
禁止玩樂之風。
（永徽二年）癸酉，詔：「自今京官及外州有獻鷹隼及犬馬者，罪之。」（資治通鑑卷一百九十九）
嚴厲的杜絕人民「揣摩上意」的心理惡習。
（永徽三年）二月，甲寅，上御安福門樓，觀百戲。乙卯，上謂侍臣曰：「昨登樓，欲以觀人情及風谷奢儉，非為聲樂。朕聞胡人善為擊鞠之戲，嘗一觀之。昨初升樓，即有群胡擊鞠，意謂朕篤好之也。帝王所為，豈宜容易。朕已焚此鞠，冀杜胡人窺望之情，亦因以自誡。」（資治通鑑卷一百九十九）
永徽一朝之問題才不至衍生出難以收拾的局面。
補充一點，由高履行之言，我們可知高宗時戶口之數目尚不如隋。
丁丑，上問戶部尚書高履行：「去年進戶多少？」履行奏：「去年進戶總一十五萬。」因問隋代及今日見戶，履行奏：「隋開皇中，戶八百七十萬，即今戶三百八十萬。」履行，士廉之子也。（資治通鑑卷一百九十九）
